More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3301 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  100 
 
 		 440 aa  894    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  64.01 
 
 		 441 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  61.1 
 
 		 442 aa  567  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  59.5 
 
 		 448 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  58.85 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  60.05 
 
 		 444 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  59.32 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  57.31 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  57.47 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  56.82 
 
 		 453 aa  521  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  57.27 
 
 		 453 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  57.05 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  59.04 
 
 		 459 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  57.76 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  58.45 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  54.36 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  54.57 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  55.66 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  54.12 
 
 		 456 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  54.09 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  54.09 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  53.35 
 
 		 456 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  53.79 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  52.68 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  52.65 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  51.14 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  52.58 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  54.04 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  53.05 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  51.15 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  50.68 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  50 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  52.27 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  48.97 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  49.1 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  49.77 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  51.72 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  47.14 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  51.49 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  51.93 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  51.93 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  51.38 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  49.66 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  51.36 
 
 		 476 aa  428  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  51.14 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  49.77 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  51.25 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  50.8 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  48.08 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  46.21 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  49.31 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  47.77 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  50.34 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  50.34 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  48.05 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  47.77 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  47.4 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  47.14 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  49.19 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  47.77 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  49.09 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 470 aa  418  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  49.1 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  48.17 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  47.03 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>