293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1667 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
93 aa  184  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  59.09 
 
 
95 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  60.26 
 
 
90 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1121  preprotein translocase, YajC subunit  56.98 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00511918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  48.15 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  45.68 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  46.91 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  44.58 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  46.25 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  46.99 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  45.68 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  45.78 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  44.58 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  44.59 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
86 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
86 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
92 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  40.24 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  44.58 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1693  protein translocase subunit yajC  47.67 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155414  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  52.94 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  46.38 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  48.48 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  37.23 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  37.21 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  41.98 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>