More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0762 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  55.14 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  50.49 
 
 
110 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.34 
 
 
109 aa  120  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  49.53 
 
 
109 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  49.04 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  47.66 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  49.04 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  49.04 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  49.04 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  47.66 
 
 
109 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  49.04 
 
 
108 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.07 
 
 
108 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48.11 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  54.72 
 
 
110 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  47.66 
 
 
109 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  53.47 
 
 
106 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.9 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  46.73 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  46.46 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  45.37 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  45.37 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  49.07 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  49.02 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  45.79 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.08 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  47.17 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  46.3 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  50.96 
 
 
104 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  50.96 
 
 
104 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  50.52 
 
 
103 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  49.02 
 
 
259 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  47.06 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  44.44 
 
 
120 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  47.06 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  54.84 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  52.04 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.51 
 
 
106 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  48.48 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  48.57 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  46.53 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  44.44 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  46.67 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  47.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  48.57 
 
 
108 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  49.04 
 
 
104 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46.08 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  46.08 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  46.08 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  46.08 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  46.88 
 
 
108 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  45.28 
 
 
109 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  45.19 
 
 
107 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  50.55 
 
 
109 aa  107  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  46.3 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  46 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  42.59 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  42.59 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  42.59 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  42.59 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>