161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0086 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  199  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0085  hypothetical protein  39.39 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  38.78 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  36.27 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  37.74 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  34.95 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  34.34 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  31.48 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  36.96 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  38.55 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  34.78 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  35.42 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  35.96 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  33.7 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  34.78 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  32.58 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  32.95 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  34.78 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  31.71 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  32.29 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  32.91 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  28.87 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  41.27 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  35.35 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  31.65 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  31.65 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  29.21 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  38.82 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  31.18 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  29.21 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  29.7 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  31.63 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  30.34 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  29.41 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1366  hypothetical protein  29.91 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  31.91 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  33.02 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  31.25 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  30.68 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  34.78 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  30.77 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0584  hypothetical protein  30.67 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.992703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  36.67 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0899  hypothetical protein  37.21 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  27.55 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  29.9 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  32.18 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  32.95 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  33.7 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  33.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  33.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  29.25 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0234  hypothetical protein  37.08 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  33.7 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  29.11 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  29.21 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  29.21 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0558  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.611385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  29.21 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  32.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  29.41 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  30.39 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  30.39 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22000  hypothetical protein  32.41 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  26.26 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1974  hypothetical protein  31.34 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00191  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  32.61 
 
 		 120 aa  43.5  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  30.39 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>