167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0085 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  193  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0086  hypothetical protein  39.39 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  43.68 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  37.89 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.24 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  39.33 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  36.59 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  40.79 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  34.65 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  37.65 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  34.95 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  37.08 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  38.16 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  32 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  31.73 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  32.26 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  36.84 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  35.87 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  35.53 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  31.18 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  32.91 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  32.91 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  32.99 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  34.15 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  32.99 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  34.65 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2803  hypothetical protein  31.25 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  36.96 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  34.38 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  31.07 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  34.38 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  30.97 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  31.63 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  32.61 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  32.61 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  32.35 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  31.91 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  31.63 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1974  hypothetical protein  35.59 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  30.21 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  36.59 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  29.81 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  31.18 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  35.8 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  34.02 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  31.18 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  32.69 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  35.87 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  37.8 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0195  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  30.11 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  37.97 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  35 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  34.09 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  33.75 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  27.96 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  30.85 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  28.16 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  32.99 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>