More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2452 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  100 
 
 
430 aa  882    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  31.2 
 
 
396 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  31.84 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  32.37 
 
 
397 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  28.8 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  30.48 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  31.21 
 
 
398 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.18 
 
 
391 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.2 
 
 
370 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  31.62 
 
 
379 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.18 
 
 
372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  29.59 
 
 
388 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.97 
 
 
373 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  25.47 
 
 
379 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.49 
 
 
404 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  25 
 
 
374 aa  143  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.27 
 
 
379 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  33.06 
 
 
372 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  33.33 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  27.62 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.01 
 
 
387 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  26.89 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  28.79 
 
 
411 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  28.87 
 
 
375 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  31.45 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  38.19 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  26.61 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  32.47 
 
 
434 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25 
 
 
376 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  29.79 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  40.15 
 
 
477 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  42.57 
 
 
405 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  38.19 
 
 
441 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  34.58 
 
 
387 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  34.48 
 
 
377 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  32.95 
 
 
387 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  34.21 
 
 
377 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  38.81 
 
 
428 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  28.91 
 
 
402 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  31.09 
 
 
381 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  38.81 
 
 
438 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  38.81 
 
 
438 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  38.81 
 
 
438 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.95 
 
 
374 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  27.7 
 
 
374 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  34.74 
 
 
375 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  28.95 
 
 
361 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  33.68 
 
 
378 aa  123  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  38.97 
 
 
428 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  39.71 
 
 
420 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  32.63 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  34.22 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  32.63 
 
 
362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  34.16 
 
 
344 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.83 
 
 
366 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  36.99 
 
 
417 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  32.88 
 
 
377 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  32.88 
 
 
377 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  38.64 
 
 
362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  38.64 
 
 
362 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  25.36 
 
 
377 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.19 
 
 
416 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  33.95 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  24.06 
 
 
398 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  27.96 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  37.78 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  25.99 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  24.85 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  37.88 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  29.26 
 
 
375 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  38.03 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  26.5 
 
 
373 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  31.19 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.55 
 
 
301 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  28.34 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  37.31 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.03 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  41.46 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  26.26 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  37.7 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  35.71 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  26.2 
 
 
404 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  34.95 
 
 
243 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  25.41 
 
 
369 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.8 
 
 
309 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  25.21 
 
 
413 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  25.93 
 
 
397 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  24.87 
 
 
412 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  36.36 
 
 
411 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  25.53 
 
 
379 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  40.32 
 
 
398 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  37.06 
 
 
436 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  37.06 
 
 
436 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  37.8 
 
 
432 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.8 
 
 
430 aa  103  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  28.09 
 
 
372 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  25.3 
 
 
399 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.94 
 
 
394 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.58 
 
 
282 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  40.74 
 
 
238 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>