More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2365 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
260 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 
259 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
260 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
261 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
265 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
259 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
257 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
260 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
265 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.22 
 
 
260 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
261 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.17 
 
 
260 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.73 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
257 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
260 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  41.15 
 
 
651 aa  172  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
262 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.02 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
260 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.89 
 
 
258 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
263 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
260 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.54 
 
 
260 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
259 aa  169  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
260 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
261 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
257 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
267 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
253 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
260 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
259 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.14 
 
 
275 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
268 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.77 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.31 
 
 
661 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
262 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
260 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.92 
 
 
662 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
258 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
254 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
269 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
263 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
257 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
257 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
262 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.73 
 
 
663 aa  159  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
260 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
262 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
255 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
261 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
258 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
262 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1416  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
260 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
263 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
263 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
260 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
260 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.92 
 
 
662 aa  159  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
262 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.78 
 
 
662 aa  158  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
258 aa  158  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
262 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>