More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1107 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  100 
 
 		 537 aa  1112    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  45.06 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  43.92 
 
 		 498 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  42.83 
 
 		 498 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  39.26 
 
 		 537 aa  336  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  39.12 
 
 		 558 aa  330  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  40.36 
 
 		 512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  37.86 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  38.43 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  38.87 
 
 		 543 aa  319  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  38.89 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  38.7 
 
 		 554 aa  316  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  37.16 
 
 		 556 aa  316  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  38.31 
 
 		 554 aa  313  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  37.93 
 
 		 554 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  37.93 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  37.93 
 
 		 554 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  37.93 
 
 		 554 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  37.93 
 
 		 554 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  38.12 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.12 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  37.93 
 
 		 554 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  38.51 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  37.74 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  37.36 
 
 		 556 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  37.16 
 
 		 554 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  37.64 
 
 		 554 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  36.68 
 
 		 553 aa  300  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  37.81 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  37.55 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  37.55 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  35.84 
 
 		 592 aa  297  4e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  37.62 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  37.55 
 
 		 554 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  38.72 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  38.32 
 
 		 554 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  36.4 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  38.55 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  37.16 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  35.98 
 
 		 571 aa  292  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  36.22 
 
 		 484 aa  292  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  38.35 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  38.35 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  35.84 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  38.35 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  38.12 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  37.21 
 
 		 554 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  36.59 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  36.61 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  37.17 
 
 		 555 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  37.88 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  35.06 
 
 		 554 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  35.24 
 
 		 563 aa  277  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  35.24 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  35.06 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  35.98 
 
 		 564 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  34.67 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  35.07 
 
 		 573 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  34.94 
 
 		 596 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  35.6 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  35.87 
 
 		 638 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  33.85 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.42 
 
 		 528 aa  243  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  36.84 
 
 		 530 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  35.17 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.9 
 
 		 607 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.38 
 
 		 646 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.63 
 
 		 622 aa  212  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.46 
 
 		 610 aa  210  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.79 
 
 		 619 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.39 
 
 		 634 aa  206  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.27 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.42 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  28.75 
 
 		 632 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  28.75 
 
 		 632 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.01 
 
 		 678 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.39 
 
 		 554 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.93 
 
 		 643 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.79 
 
 		 646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.6 
 
 		 633 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.12 
 
 		 610 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.88 
 
 		 632 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.14 
 
 		 593 aa  197  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  31.7 
 
 		 589 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.5 
 
 		 635 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.71 
 
 		 617 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>