More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0341 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.17 
 
 
535 aa  634  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.97505e-06  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.51 
 
 
535 aa  644  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.51 
 
 
535 aa  644  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  62.73 
 
 
535 aa  679  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  60.37 
 
 
540 aa  687  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.64 
 
 
542 aa  654  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  58.26 
 
 
542 aa  652  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  69.33 
 
 
557 aa  788  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  62.01 
 
 
547 aa  691  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  57.14 
 
 
554 aa  640  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  57.59 
 
 
554 aa  646  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  62.89 
 
 
535 aa  674  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  57.59 
 
 
554 aa  644  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  57.83 
 
 
534 aa  650  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  58.3 
 
 
545 aa  652  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  61.41 
 
 
555 aa  686  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  65.8 
 
 
550 aa  741  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  59.11 
 
 
542 aa  637  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  55.64 
 
 
558 aa  635  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  58.54 
 
 
548 aa  638  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  58.26 
 
 
547 aa  660  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.35 
 
 
535 aa  636  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  60.26 
 
 
550 aa  657  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  59.19 
 
 
558 aa  667  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.35 
 
 
535 aa  635  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  58.85 
 
 
542 aa  635  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.69 
 
 
545 aa  640  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  63.65 
 
 
533 aa  691  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  59.48 
 
 
542 aa  644  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  59.44 
 
 
542 aa  669  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  58.75 
 
 
542 aa  667  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  59.29 
 
 
542 aa  641  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  61.78 
 
 
555 aa  687  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  58.15 
 
 
545 aa  638  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.72 
 
 
535 aa  637  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  60.85 
 
 
533 aa  668  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.15 
 
 
543 aa  654  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  58.81 
 
 
544 aa  639  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  58.55 
 
 
542 aa  637  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  56.17 
 
 
536 aa  650  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  65.86 
 
 
534 aa  696  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  57.14 
 
 
557 aa  637  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.24409e-06  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  56.17 
 
 
536 aa  650  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  60.73 
 
 
555 aa  686  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  57.88 
 
 
555 aa  643  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  60.78 
 
 
542 aa  673  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  65.14 
 
 
547 aa  748  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  59.23 
 
 
559 aa  644  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  60.62 
 
 
540 aa  666  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  60 
 
 
542 aa  676  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  58.72 
 
 
554 aa  636  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.3 
 
 
533 aa  648  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  58.56 
 
 
551 aa  672  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  59.11 
 
 
557 aa  637  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  60.73 
 
 
555 aa  686  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  57.2 
 
 
555 aa  641  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.4 
 
 
534 aa  644  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  100 
 
 
553 aa  1146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  60.19 
 
 
542 aa  677  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  59.78 
 
 
542 aa  670  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  58.56 
 
 
543 aa  651  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  59.48 
 
 
555 aa  684  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  61.79 
 
 
546 aa  685  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  63.84 
 
 
533 aa  695  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  58.33 
 
 
545 aa  651  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  59.63 
 
 
550 aa  673  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  59.67 
 
 
543 aa  662  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  63.33 
 
 
534 aa  722  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98786e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  58.58 
 
 
559 aa  639  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  59.14 
 
 
545 aa  645  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  59.03 
 
 
542 aa  637  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  58.26 
 
 
542 aa  652  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  55.54 
 
 
535 aa  636  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  65.62 
 
 
546 aa  733  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.54 
 
 
535 aa  636  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.35 
 
 
535 aa  635  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  66.6 
 
 
546 aa  756  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.11 
 
 
547 aa  672  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  59.93 
 
 
536 aa  662  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.43339e-08  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  59.55 
 
 
531 aa  677  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  62.18 
 
 
549 aa  687  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  59.14 
 
 
545 aa  647  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  58.56 
 
 
543 aa  652  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  61.25 
 
 
538 aa  678  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  63.15 
 
 
546 aa  687  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  60.41 
 
 
552 aa  681  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.62 
 
 
535 aa  641  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  59.33 
 
 
543 aa  659  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  59.74 
 
 
545 aa  646  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  64.68 
 
 
547 aa  717  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  58.07 
 
 
547 aa  659  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.82 
 
 
535 aa  658  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  62.13 
 
 
555 aa  686  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  59 
 
 
531 aa  664  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.49 
 
 
534 aa  649  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.2 
 
 
533 aa  640  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  61.41 
 
 
555 aa  687  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  65 
 
 
547 aa  713  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  58.12 
 
 
532 aa  652  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  57.54 
 
 
543 aa  639  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>