More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0033 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0033  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000645659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1896  hypothetical protein  30.54 
 
 
258 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.20774e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  30.28 
 
 
261 aa  120  2e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  33.2 
 
 
264 aa  113  4e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  30.45 
 
 
270 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  33.18 
 
 
260 aa  110  2e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  33.18 
 
 
260 aa  110  2e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  32.82 
 
 
257 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  30.23 
 
 
261 aa  109  4e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  29.08 
 
 
256 aa  108  9e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.09401e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.9 
 
 
270 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  28.29 
 
 
256 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  29.43 
 
 
260 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  30.33 
 
 
257 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  33.67 
 
 
265 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  30.15 
 
 
261 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  31.31 
 
 
260 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  30.24 
 
 
260 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  30.24 
 
 
260 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  28.12 
 
 
256 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  32.29 
 
 
258 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  33.16 
 
 
260 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  27.73 
 
 
258 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.28 
 
 
267 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  34.2 
 
 
259 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  27.41 
 
 
261 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  30.13 
 
 
261 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  29.61 
 
 
266 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  30.13 
 
 
261 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.21 
 
 
255 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  7.88442e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  30.13 
 
 
261 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  30.37 
 
 
260 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  29.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  29.02 
 
 
261 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  28.91 
 
 
261 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  29.2 
 
 
258 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  30.77 
 
 
406 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  29.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  29.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  30.23 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  29.3 
 
 
262 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  29.2 
 
 
258 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  29.3 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  29.44 
 
 
259 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  33.18 
 
 
255 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  28.79 
 
 
263 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.15 
 
 
267 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  30.3 
 
 
430 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  29.28 
 
 
265 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  30.23 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  30.23 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  30.23 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.76 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  27.73 
 
 
257 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  30.63 
 
 
259 aa  99  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  30.05 
 
 
258 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  27.95 
 
 
377 aa  98.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  30.05 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.07 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  30.05 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  32.46 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  27.84 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56221e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.07 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  33.89 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  7.24337e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  27.45 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  28.9 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  30.61 
 
 
370 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  26.34 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  29.95 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  29.95 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  29.65 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  29.83 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  27.06 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  26.89 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  29.95 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  27.21 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  30.46 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  31.09 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  26.53 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  27.69 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  28.37 
 
 
258 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  27.69 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  25.66 
 
 
260 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  27.69 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  25.48 
 
 
260 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  26.36 
 
 
265 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  31.09 
 
 
255 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  25.66 
 
 
260 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  26.51 
 
 
260 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  25.88 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  25.87 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  26.25 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  28.31 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  29.29 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  27.18 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  29.29 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>