More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_912 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  148  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  58.57 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  59.42 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  54.29 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  57.97 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  59.42 
 
 		 81 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.82 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.71 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  57.97 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  54.29 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.71 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  57.97 
 
 		 72 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  57.97 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  59.42 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  57.14 
 
 		 68 aa  87.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.52 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56.52 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  55.07 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  57.97 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  55.07 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  52.86 
 
 		 206 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  64.81 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50.72 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.47 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  53.62 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  47.83 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  54.29 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  47.14 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  47.14 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  52.86 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  47.14 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  47.14 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  54.41 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  48.57 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  51.43 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.14 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  48.57 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  52.17 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.71 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  47.62 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  60.34 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  60.34 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  51.56 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  54.29 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  47.89 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.86 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  55.56 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  52.17 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  50.72 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  52.86 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  48.57 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.86 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  47.83 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  52.86 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.24 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  44.93 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>