33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4131 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
214 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 
209 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  24.88 
 
 
225 aa  89  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  29.73 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  29.03 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  26.87 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  26.44 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  29.95 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  27.4 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  22.87 
 
 
220 aa  61.6  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  27.84 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  26.15 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1312  type IV pilus assembly PilZ  29.61 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.244718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  23.3 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  23.12 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  26.5 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  29 
 
 
214 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0078  type IV pilus assembly PilZ  29.11 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.970228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  23.88 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  24.24 
 
 
267 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  27.07 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  20.87 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 
314 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  22.02 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  24.22 
 
 
259 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  29.63 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  30.28 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  26.46 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  25.86 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  28.85 
 
 
317 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>