40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2669 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  100 
 
 
410 aa  845    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  64.96 
 
 
411 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  51.21 
 
 
407 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  58.7 
 
 
342 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  43.38 
 
 
517 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  42.05 
 
 
395 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  42.07 
 
 
485 aa  325  7e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  40.62 
 
 
421 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  40.95 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  39.52 
 
 
406 aa  305  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  38.18 
 
 
491 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 
536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.95 
 
 
521 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.99 
 
 
540 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.99 
 
 
398 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  38.12 
 
 
398 aa  269  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 
532 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  35.83 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  36.06 
 
 
433 aa  235  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 
433 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 
432 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  33.54 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  31.29 
 
 
321 aa  196  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 
391 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  30.31 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  27.88 
 
 
434 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.7 
 
 
316 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  27.43 
 
 
295 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  24.08 
 
 
270 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 
416 aa  86.7  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  23.67 
 
 
270 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  31.4 
 
 
140 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  27.56 
 
 
148 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.27 
 
 
463 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  29.41 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.17 
 
 
576 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.535404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.48 
 
 
459 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
615 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  31.58 
 
 
311 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.15 
 
 
177 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>