199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2295 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  100 
 
 
164 aa  335  2e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  60.25 
 
 
165 aa  181  4e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  55.28 
 
 
168 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  55.28 
 
 
168 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  57.76 
 
 
164 aa  173  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  56.13 
 
 
172 aa  172  1e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  57.14 
 
 
164 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  54.43 
 
 
158 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  50.62 
 
 
166 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  51.85 
 
 
166 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  51.85 
 
 
166 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  56.95 
 
 
164 aa  164  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  55.28 
 
 
164 aa  164  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  49.69 
 
 
168 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  51.55 
 
 
166 aa  163  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  51.55 
 
 
165 aa  163  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  51.55 
 
 
168 aa  163  1e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  56.67 
 
 
167 aa  162  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  52.47 
 
 
166 aa  162  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  52.47 
 
 
166 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  54.19 
 
 
166 aa  161  4e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  51.25 
 
 
166 aa  160  5e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  51.25 
 
 
166 aa  160  5e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  51.23 
 
 
166 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  51.85 
 
 
166 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  52.12 
 
 
167 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  56.6 
 
 
163 aa  154  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  50.94 
 
 
168 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  51.27 
 
 
165 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  48.12 
 
 
166 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  49.38 
 
 
163 aa  152  3e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  50.62 
 
 
173 aa  151  3e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  50 
 
 
165 aa  151  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  52.76 
 
 
166 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  47.53 
 
 
165 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  53.75 
 
 
169 aa  145  2e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  47.53 
 
 
166 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  49.38 
 
 
166 aa  139  1e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.4 
 
 
167 aa  139  2e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  48.77 
 
 
165 aa  137  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  46.91 
 
 
166 aa  137  8e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  47.27 
 
 
166 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  47.53 
 
 
166 aa  133  1e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  45.1 
 
 
166 aa  130  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  43.83 
 
 
168 aa  129  1e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  40.48 
 
 
169 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  40.8 
 
 
184 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  40.68 
 
 
182 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  41.72 
 
 
167 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  38.42 
 
 
185 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  39.63 
 
 
169 aa  119  1e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  44.67 
 
 
228 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  41.95 
 
 
263 aa  117  5e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  38.64 
 
 
185 aa  117  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  41.95 
 
 
202 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  44.63 
 
 
182 aa  114  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  40.99 
 
 
170 aa  112  2e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  41.38 
 
 
202 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  39.63 
 
 
170 aa  111  4e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  39.63 
 
 
170 aa  111  4e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  41.38 
 
 
202 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  40.72 
 
 
184 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  32.42 
 
 
182 aa  108  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  39.55 
 
 
182 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  35.93 
 
 
184 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.96 
 
 
146 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  37.08 
 
 
184 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  45.86 
 
 
140 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  42.5 
 
 
167 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.04 
 
 
168 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.34 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.41 
 
 
146 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  38.29 
 
 
202 aa  99.8  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.11 
 
 
139 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  35.8 
 
 
196 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  43.51 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  45.11 
 
 
139 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.45358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  35.67 
 
 
233 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  45.8 
 
 
140 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  45.04 
 
 
140 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  45.04 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  45.04 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  45.04 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  45.45 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  44.27 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  35.2 
 
 
191 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  39.02 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  38.41 
 
 
178 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  42.86 
 
 
139 aa  95.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>