More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1980 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
337 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  58.57 
 
 
330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  58.57 
 
 
330 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  58.93 
 
 
320 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  58.36 
 
 
330 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  58.36 
 
 
320 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  58.26 
 
 
330 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  58.26 
 
 
330 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  58.26 
 
 
330 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  58.68 
 
 
330 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  58.26 
 
 
330 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  56.15 
 
 
320 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  59.31 
 
 
328 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.26 
 
 
324 aa  315  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  47.32 
 
 
324 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  47.32 
 
 
324 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  47.32 
 
 
324 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  47.32 
 
 
324 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.32 
 
 
324 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  47.32 
 
 
324 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  47.32 
 
 
324 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  47.32 
 
 
324 aa  309  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  47 
 
 
324 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  48.75 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  49.35 
 
 
321 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  49.35 
 
 
321 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  45.43 
 
 
326 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  45.43 
 
 
326 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.38 
 
 
322 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.11 
 
 
326 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  45.43 
 
 
324 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.79 
 
 
325 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  45.43 
 
 
324 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  45.43 
 
 
324 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  45.43 
 
 
324 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  48.05 
 
 
324 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  48.38 
 
 
321 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  56.86 
 
 
321 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  56.47 
 
 
321 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  56.47 
 
 
321 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3708  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.75 
 
 
327 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.971324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  45.11 
 
 
324 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  55.29 
 
 
321 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.08 
 
 
321 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  47.73 
 
 
325 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  47.73 
 
 
325 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  47.73 
 
 
325 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.37 
 
 
321 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  47.4 
 
 
325 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  46.56 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  44.76 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  44.48 
 
 
320 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.83 
 
 
320 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  43.53 
 
 
321 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.2 
 
 
320 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  52.03 
 
 
329 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2904  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.13 
 
 
322 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  45.71 
 
 
341 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  46.2 
 
 
324 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  46.89 
 
 
324 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  46.93 
 
 
340 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.25 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  48.78 
 
 
325 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  46.03 
 
 
328 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  45.37 
 
 
315 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3376  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  52.77 
 
 
320 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.555118  normal  0.118844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2382  gluconate 2-dehydrogenase  52.77 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54026  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  45.71 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  48.26 
 
 
325 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.78 
 
 
324 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.95 
 
 
326 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.95 
 
 
326 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.95 
 
 
328 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.92 
 
 
326 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2568  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.11 
 
 
320 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217021  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  48.43 
 
 
324 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30550  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  46.38 
 
 
326 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  41.56 
 
 
322 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4585  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.39 
 
 
324 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177962  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.34 
 
 
325 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.21 
 
 
319 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.21 
 
 
319 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  41.25 
 
 
322 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.64 
 
 
338 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.87 
 
 
335 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2069  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.44 
 
 
338 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  hitchhiker  0.00440451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  43.85 
 
 
348 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.32 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.98 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.39 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  43.97 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  44.16 
 
 
329 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.04 
 
 
324 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1261  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.04 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829817  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.32 
 
 
329 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  44.48 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  44.48 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  44.48 
 
 
352 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.48 
 
 
329 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.48 
 
 
329 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>