41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4894 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  43.52 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  37.7 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  37.17 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  32.28 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  33.85 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  32.28 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  33.85 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  31.98 
 
 		 509 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  36.56 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 		 233 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  34.65 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  31.39 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  35.29 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  32.28 
 
 		 197 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  43.55 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  35.5 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  28.65 
 
 		 871 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  28.57 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  24.31 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  27.91 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  24 
 
 		 424 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  25.13 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.94 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  24.73 
 
 		 257 aa  52  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  25.7 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  27.78 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  22.8 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.77 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  27.14 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  24.12 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  24.16 
 
 		 593 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  22.58 
 
 		 479 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  24.37 
 
 		 379 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.95 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  21.97 
 
 		 1072 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  23.32 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  23.91 
 
 		 447 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  22.04 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  24.34 
 
 		 593 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  26.03 
 
 		 269 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>