More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4571 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 319 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  51.31 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  46.38 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  48.33 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  47.67 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  50.33 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  46.67 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  44.33 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  44.67 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  46 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  45.1 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  43.65 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  44.12 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  44.12 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  44.12 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  43.79 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  43.32 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  43.32 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  43.32 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  43.32 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  43.32 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  43.32 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  43.32 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  43 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  43.46 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  43 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  44.52 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  42.3 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  42.33 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  42.62 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  41.86 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  43.62 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  41.78 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  41.78 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  42.43 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  40.73 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  41.06 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  41.97 
 
 		 473 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  41.97 
 
 		 449 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  41.97 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  41.97 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  42.19 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  42.19 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  40.4 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  39.34 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  38.22 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  39.53 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  37.58 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  37.58 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  38.89 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35.88 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  30.59 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  37.33 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  34.64 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  37.12 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  36.51 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  34.24 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  35.47 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  34.45 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.63 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  27.63 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.13 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  32.96 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  29.41 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.56 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  37.67 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  29.84 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.27 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.26 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>