More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1053 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1053  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.44097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  96.17 
 
 
209 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.66369e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1240  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  91.87 
 
 
209 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  1.81585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0957  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.21 
 
 
244 aa  162  4e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  53.1 
 
 
161 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  53.29 
 
 
163 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  46.45 
 
 
247 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.57501e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0108  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.35 
 
 
193 aa  142  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  46.29 
 
 
254 aa  140  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  45.7 
 
 
254 aa  139  2e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  50.92 
 
 
163 aa  138  5e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  55.88 
 
 
174 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4201  peptidylprolyl isomerase  51.63 
 
 
171 aa  135  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.231436  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  42.77 
 
 
533 aa  129  2e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  49.66 
 
 
176 aa  129  2e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.84 
 
 
164 aa  127  1e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  43.02 
 
 
197 aa  127  1e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  42.58 
 
 
172 aa  127  1e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  46.72 
 
 
164 aa  127  1e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3599  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
237 aa  127  1e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  46.3 
 
 
184 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  47.02 
 
 
194 aa  125  4e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  43.23 
 
 
172 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  46.71 
 
 
175 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  49.01 
 
 
175 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.85 
 
 
378 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1388  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.04 
 
 
245 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  45.26 
 
 
164 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  48.15 
 
 
163 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2833  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.62 
 
 
182 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.370982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  45.7 
 
 
188 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.76 
 
 
201 aa  121  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52 
 
 
196 aa  120  1e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.79 
 
 
376 aa  120  1e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  44.52 
 
 
174 aa  120  2e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  45.99 
 
 
629 aa  120  2e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.3 
 
 
310 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  44.59 
 
 
188 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  43.42 
 
 
174 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  41.67 
 
 
187 aa  119  4e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  53.15 
 
 
206 aa  119  4e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  46.97 
 
 
629 aa  119  5e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0773  peptidylprolyl isomerase  42.53 
 
 
228 aa  118  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  44.87 
 
 
181 aa  118  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0746  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.71 
 
 
239 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000529478  hitchhiker  0.00499844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  40.8 
 
 
376 aa  117  1e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  47.41 
 
 
141 aa  117  2e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.25 
 
 
160 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  53.08 
 
 
665 aa  115  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  45.77 
 
 
571 aa  115  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.88 
 
 
195 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  43.14 
 
 
657 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  39.08 
 
 
287 aa  114  8e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2056  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  37.91 
 
 
279 aa  113  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660351  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  42.41 
 
 
178 aa  113  2e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0632  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.15 
 
 
250 aa  113  2e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  36.45 
 
 
223 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  53.03 
 
 
172 aa  112  4e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  43.03 
 
 
181 aa  112  4e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  43.23 
 
 
176 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  42.75 
 
 
156 aa  111  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23203  predicted protein  42.42 
 
 
187 aa  110  1e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.46 
 
 
372 aa  110  1e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  38.51 
 
 
241 aa  110  1e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  44.7 
 
 
222 aa  110  1e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  43.15 
 
 
573 aa  110  2e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  45.04 
 
 
155 aa  110  2e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  49.17 
 
 
176 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.33 
 
 
468 aa  109  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2438  peptidylprolyl isomerase  45.45 
 
 
250 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  34.98 
 
 
230 aa  108  4e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  42.58 
 
 
147 aa  109  4e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.14 
 
 
310 aa  108  4e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  34.98 
 
 
230 aa  108  4e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  33.82 
 
 
219 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0109  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  39.62 
 
 
282 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.74 
 
 
195 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  45.64 
 
 
168 aa  108  8e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5201  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.52 
 
 
145 aa  108  8e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12899  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  45.7 
 
 
168 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2997  Peptidylprolyl isomerase  43.66 
 
 
169 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.54367e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  41.4 
 
 
178 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  40.34 
 
 
173 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6104  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family-like protein  37.29 
 
 
289 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  45.74 
 
 
141 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.19 
 
 
139 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  42.76 
 
 
266 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.26 
 
 
310 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  50.83 
 
 
181 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06894  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 2 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8)(Cyclophilin-60)(Cyclophilin-like protein Cyp-60) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXT6]  50.79 
 
 
580 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.242482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  38.5 
 
 
509 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0045  peptidylprolyl isomerase  50.36 
 
 
154 aa  104  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0601501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6860  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.95 
 
 
171 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  43.35 
 
 
180 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  44.93 
 
 
162 aa  103  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  44.97 
 
 
168 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  47.33 
 
 
176 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  44.97 
 
 
168 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  40.38 
 
 
177 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  43.89 
 
 
182 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>