More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0518 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  90.16 
 
 		 306 aa  565  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  89.84 
 
 		 306 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  48.5 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 309 aa  295  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  45.51 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  45.48 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.79 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  44.55 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  46.18 
 
 		 302 aa  275  7e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.82 
 
 		 311 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  42.05 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  43.71 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.9 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  45.9 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  42.14 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  45.81 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  42 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.82 
 
 		 326 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  41.39 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  45.42 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  42.24 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  42.38 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.62 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  43.89 
 
 		 333 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.64 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 318 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.83 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  42 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  41.47 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  40 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40 
 
 		 335 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  42 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.02 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  38.11 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  39.4 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  38.74 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  39.4 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.4 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.4 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  39.4 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  39.4 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  39.4 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.67 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  38.74 
 
 		 318 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  40.67 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 311 aa  237  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 311 aa  237  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  40.95 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.46 
 
 		 317 aa  237  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.28 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  39.13 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  38.69 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  39.13 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.46 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  41.12 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  41.12 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  41.53 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  41.52 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  39.13 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  39.07 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  42 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  42 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  40.53 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  40.73 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  38.69 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  43.56 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  39.2 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.67 
 
 		 427 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  38.33 
 
 		 331 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  44.88 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  42.33 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  43 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  39.2 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  42.29 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>