More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0228 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  87.33 
 
 		 221 aa  403  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  88.24 
 
 		 221 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  56.13 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  47.87 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  44.24 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  48.79 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  44.23 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.93 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  46.86 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  41.94 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  42.52 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  40.65 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  39.09 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  40.55 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  40.76 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  41.26 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  43.46 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  42.33 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  41.26 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  40.58 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  39.61 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  39.61 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  40.1 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  39.9 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  38.36 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  35.27 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  35 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.32 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.32 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.14 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  36.36 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  32.87 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  36.36 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  35.1 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  35.23 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  36.62 
 
 		 237 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 237 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  34.93 
 
 		 236 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  38.65 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.91 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  32.26 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  35.1 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.26 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.84 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  35.41 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  34.93 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 240 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  34.93 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  34.93 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.58 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  34.93 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.1 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  34.45 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  34.45 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  33.82 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>