47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0023 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  664  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  37.35 
 
 
438 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  33.64 
 
 
275 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  35.18 
 
 
398 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  31.45 
 
 
249 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  31.55 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  30.79 
 
 
250 aa  70.1  6e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  31.46 
 
 
250 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  29.47 
 
 
252 aa  66.6  6e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  30.79 
 
 
250 aa  64.3  3e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  28.77 
 
 
262 aa  61.6  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  37.04 
 
 
249 aa  61.6  2e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  38.64 
 
 
250 aa  60.1  5e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  31.47 
 
 
260 aa  59.7  7e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  31.65 
 
 
249 aa  58.5  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  28.63 
 
 
272 aa  55.8  9e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  27.15 
 
 
252 aa  55.1  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  29.36 
 
 
253 aa  55.1  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.94 
 
 
253 aa  54.3  3e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  30.14 
 
 
256 aa  54.3  3e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
248 aa  53.9  4e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  29.29 
 
 
247 aa  53.5  4e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  27.59 
 
 
239 aa  52  1e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  25.1 
 
 
241 aa  51.6  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.79324e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  24.65 
 
 
268 aa  49.7  7e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  32.79 
 
 
242 aa  49.3  8e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  37.23 
 
 
295 aa  49.3  9e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  21.55 
 
 
211 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  30.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.84 
 
 
248 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  28.09 
 
 
271 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  27.48 
 
 
242 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  27.14 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  31.97 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  29.96 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  24.04 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  6.98926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  21.83 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  30.77 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  28.46 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  32.5 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.21 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  23.59 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  9.45883e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  20.86 
 
 
246 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  36.67 
 
 
285 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  31.82 
 
 
253 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  44.9 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>