172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3490 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  71.91 
 
 		 267 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  75.77 
 
 		 265 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  72.24 
 
 		 266 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  70.94 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  67.42 
 
 		 268 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  62.74 
 
 		 265 aa  339  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  58.56 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  57.92 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  57.81 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  54.79 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  55.47 
 
 		 267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  57.59 
 
 		 265 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  53.49 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  53.05 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  53.49 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  55.68 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  52.71 
 
 		 270 aa  294  8e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  54.41 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  54.02 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  57.03 
 
 		 267 aa  291  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  51.53 
 
 		 285 aa  288  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  53.05 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  53.88 
 
 		 264 aa  285  7e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  55.77 
 
 		 263 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  55.73 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  51.15 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 		 265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  54.23 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  50.38 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  49.43 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  52.69 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  49.21 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.67 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  47.31 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.96 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.22 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.19 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  45 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  44.7 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  39.85 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  40.87 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  42 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  41.53 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  41.63 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.02 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  39.83 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  34.35 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  33.83 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  39.63 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  33.59 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  35.09 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.21 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  29.93 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  35.02 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.83 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  30.22 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  36.9 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  30.8 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  30.57 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  30.57 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  31.3 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  30.8 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  30.8 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  30.8 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  30.8 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  30.8 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  30.31 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  30.57 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.23 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  30.31 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  32.68 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  28.68 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  28.35 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  28.35 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  28.35 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30.65 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  29.77 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  29.62 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.8 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  30.38 
 
 		 295 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  30 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  29.39 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  30 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  29.39 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  30.19 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  29.34 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  27.27 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  29.17 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  27.65 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  27.59 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  27.59 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  27.59 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  27.59 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  27.59 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  30.86 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  28.29 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  27.41 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  27.41 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  27.41 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>