299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1817 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  68.13 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  61.16 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  59.17 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  64.71 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  49.49 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  47.56 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  46.53 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  49.35 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  49.35 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  48.28 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  49.48 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  48.96 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  44.86 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  40.38 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  46 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  47.22 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  46 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  44.58 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  42.57 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  52.5 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  38.66 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  37.17 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  50.62 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  47.25 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  40.96 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  35.07 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  48.57 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  39.18 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  47.25 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  43.84 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  45.57 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  45.57 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  36.94 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  60.71 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  60.71 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  37.72 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  44.21 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.76 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  37.25 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  37.17 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  41.38 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  39.62 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  40.83 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  38.26 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  46.91 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  45.57 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  42.71 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  46.24 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  44.09 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  46.59 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  46.59 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  36.73 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  37.29 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  37.89 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.67 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>