47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4012 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  96.86 
 
 		 223 aa  443  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  90.58 
 
 		 223 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  90.13 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  83.86 
 
 		 223 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  78.83 
 
 		 244 aa  367  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  78.83 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  78.83 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  73.97 
 
 		 228 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  76.96 
 
 		 228 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  75.49 
 
 		 225 aa  331  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  74.29 
 
 		 224 aa  328  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  72.86 
 
 		 227 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  74.27 
 
 		 227 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  69.47 
 
 		 226 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  68.58 
 
 		 226 aa  318  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  68.81 
 
 		 224 aa  313  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  70.39 
 
 		 225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  66.97 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  67.89 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  67.89 
 
 		 301 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  67.89 
 
 		 301 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  67.89 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  67.89 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  67.89 
 
 		 301 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  64.55 
 
 		 222 aa  301  5.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  70.3 
 
 		 253 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  70.3 
 
 		 253 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  70.3 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  68.63 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  67.96 
 
 		 219 aa  297  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  70.44 
 
 		 207 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  69.95 
 
 		 207 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  32.33 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  34.78 
 
 		 323 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  34.51 
 
 		 321 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  38.2 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  37.71 
 
 		 321 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  60.61 
 
 		 100 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  32.19 
 
 		 322 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  26.84 
 
 		 337 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  27.93 
 
 		 321 aa  89  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  27.19 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  26.26 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  23.61 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  25.31 
 
 		 490 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  23.67 
 
 		 332 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>