23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0634 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  44.78 
 
 
147 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  34.04 
 
 
153 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  37.6 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  35.2 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  35.54 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  36.07 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  31.94 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  30.15 
 
 
800 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  34.04 
 
 
235 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  28.81 
 
 
2454 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  26.47 
 
 
1248 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  30.58 
 
 
2039 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  27.91 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  26.28 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  28.87 
 
 
322 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  27.78 
 
 
335 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  20.86 
 
 
376 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  26.67 
 
 
573 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  28.47 
 
 
410 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 
2507 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.39 
 
 
11716 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>