More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1540 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  46.41 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  43.46 
 
 
240 aa  222  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  49.36 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  43.9 
 
 
244 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 
362 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 
365 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
255 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  42.02 
 
 
256 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  42 
 
 
254 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
255 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  43.55 
 
 
250 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  44.54 
 
 
360 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.89 
 
 
364 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
286 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  40.16 
 
 
352 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  38.56 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  38.68 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 
256 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
284 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 
252 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 
240 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 
255 aa  169  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  46.46 
 
 
356 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  42.31 
 
 
337 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  39.08 
 
 
347 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 
284 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
350 aa  168  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2388  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 
249 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 
287 aa  168  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  38.59 
 
 
254 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 
252 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1172  ABC transporter related  47.22 
 
 
251 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.867834  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.44 
 
 
254 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  37.07 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  36.51 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  34.73 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  37.45 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  38.06 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  37.55 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
366 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 
253 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  39.92 
 
 
259 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.41 
 
 
249 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
251 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
286 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
259 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1116  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
249 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.493823  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0184  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1447  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1476  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  41.99 
 
 
351 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  39.53 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0190  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
329 aa  162  6e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2686  phosphate transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
265 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0630967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3272  phosphate transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
265 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143231  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  39.68 
 
 
245 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
286 aa  161  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  40.16 
 
 
257 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  43.97 
 
 
252 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  41.48 
 
 
237 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  40.32 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1887  phosphate ABC transporter permease  36.8 
 
 
261 aa  161  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  37.55 
 
 
242 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
253 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
253 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  35.51 
 
 
248 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  37.55 
 
 
242 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
271 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  39.58 
 
 
265 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
255 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
271 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  38 
 
 
284 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  40 
 
 
299 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
252 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
249 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4289  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
249 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
255 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
255 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0509  phosphate transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  39.29 
 
 
259 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
242 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
255 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
249 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0891  phosphate transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
274 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2591  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
249 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318671  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
255 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 
246 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.36 
 
 
244 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
272 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>