More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1130 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  69.69 
 
 		 290 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.34 
 
 		 291 aa  345  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.1 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  61.86 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  52.4 
 
 		 292 aa  308  6.999999999999999e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  56.46 
 
 		 294 aa  308  9e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.58 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 293 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  54.36 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  50.85 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.33 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  54.05 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  50 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  50 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.83 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  50.82 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.5 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  49.5 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  49.01 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.5 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  48.34 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  51.96 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  48.84 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  52.29 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  50 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3765  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50.66 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  49.83 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  48.64 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03306  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4774  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0259  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03259  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3936  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3655  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3865  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  50.65 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3860  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  50 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  47.85 
 
 		 302 aa  254  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  47.23 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  46.86 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  46.71 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4304  branched-chain amino acid transport protein BraD  49.51 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  48.55 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.2 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50530  branched-chain amino acid transport protein BraD  49.51 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  49.18 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  48.21 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  46.28 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  44.37 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.36 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.03 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  48.95 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.91 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  47.91 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.91 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.91 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  47.71 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.87 
 
 		 316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>