More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1979 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  100 
 
 		 433 aa  854    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  44.66 
 
 		 442 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  42.79 
 
 		 471 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 453 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 453 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  40.14 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  41.11 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 452 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 452 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.47 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  40.38 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 449 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 453 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  40.28 
 
 		 453 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  38.33 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  37.24 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  38.72 
 
 		 501 aa  266  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  38.6 
 
 		 500 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  37.19 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 509 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.99 
 
 		 434 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 505 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  32.41 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.65 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  31.71 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  31.59 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  31.64 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 448 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  29.82 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.05 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  29.82 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  30.11 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  29.36 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  32.96 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  29.36 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 		 450 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  31.97 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  31.75 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.05 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  29.52 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  30.61 
 
 		 448 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  29.36 
 
 		 436 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  35.9 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  31.95 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.86 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 430 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  31 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.22 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  29.2 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  30.84 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  32.41 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  28.7 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  31.67 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 717 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.84 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.5 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  34.06 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0872586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3275  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.18 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  35.08 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>