61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0182 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  100 
 
 		 138 aa  277  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.247211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3139  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.21 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1903  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0351843  normal  0.135941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2561  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  normal  0.0763092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2484  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000695377  normal  0.223616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2441  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2448  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  37.84 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  42.53 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000470709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0121  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0127527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2602  putative solute/DNA competence effector  36.28 
 
 		 213 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1105  putative solute/DNA competence effector  36.54 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000947436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  42.53 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  38.24 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1672  putative solute/DNA competence effector  37.25 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000366609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1747  putative solute/DNA competence effector  37.25 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1777  putative solute/DNA competence effector  37.25 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205752  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  35.59 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  41.24 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  40 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  38.54 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2132  putative solute/DNA competence effector  37.25 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000562228  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1801  putative solute/DNA competence effector  37.25 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1721  putative solute/DNA competence effector  34.48 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  37.63 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  36.56 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  37.63 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2229  putative solute/DNA competence effector  34.51 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.180207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0034  hypothetical protein  42.67 
 
 		 200 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00139041  normal  0.0848547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  36.56 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  33.67 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3447  hypothetical protein  34.38 
 
 		 279 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  35.48 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  38.36 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  33.98 
 
 		 237 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  33.98 
 
 		 237 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  33.98 
 
 		 237 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  33.01 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  34.51 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0187  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  38.27 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 211 aa  47.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1033  hypothetical protein  31 
 
 		 239 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0842196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  38.36 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3812  activator of osmoprotectant transporter  33.66 
 
 		 228 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0862  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.33 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0169  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  37.04 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0459261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  36.26 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2274  Fertility inhibition FinO-like protein  33 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0307  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  34.18 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>