45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5407 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  75.66 
 
 		 226 aa  358  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  69.47 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  73.93 
 
 		 223 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  69.16 
 
 		 223 aa  318  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  70.91 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  67.84 
 
 		 223 aa  316  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  70.23 
 
 		 223 aa  315  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  73.08 
 
 		 223 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  73.08 
 
 		 223 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  73.08 
 
 		 244 aa  314  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  69.27 
 
 		 224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  71.01 
 
 		 225 aa  311  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  69.9 
 
 		 227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  71.92 
 
 		 228 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  64.13 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  68.93 
 
 		 227 aa  296  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  69.23 
 
 		 225 aa  291  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  69.57 
 
 		 225 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  66.82 
 
 		 225 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  66.82 
 
 		 225 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  69.08 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  69.08 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  66.82 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  66.82 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  66.82 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  68.6 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  66.36 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  68.63 
 
 		 207 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  63.26 
 
 		 224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  68.14 
 
 		 207 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  61.79 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  60.28 
 
 		 219 aa  264  8e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  71.43 
 
 		 100 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  32.88 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  37.08 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  37.08 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  37.08 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  29.28 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  31.42 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  33.78 
 
 		 322 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  30.51 
 
 		 321 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  27.81 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  24.88 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  22.44 
 
 		 332 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>