More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0479 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  53.21 
 
 
812 aa  744  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  57 
 
 
704 aa  723  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  55.07 
 
 
972 aa  914  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  56.72 
 
 
846 aa  726  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  57.77 
 
 
791 aa  764  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  53.06 
 
 
783 aa  665  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  56.35 
 
 
800 aa  818  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  52.67 
 
 
745 aa  666  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  57.42 
 
 
799 aa  845  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  56.29 
 
 
801 aa  812  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  56.7 
 
 
712 aa  749  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  53.77 
 
 
762 aa  669  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  56.87 
 
 
748 aa  801  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  54.17 
 
 
709 aa  722  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  56.93 
 
 
799 aa  834  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  55.74 
 
 
984 aa  978  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  57.3 
 
 
794 aa  736  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  57.74 
 
 
799 aa  880  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  56.72 
 
 
846 aa  726  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  57.34 
 
 
800 aa  878  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  50.54 
 
 
753 aa  656  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  56.32 
 
 
834 aa  719  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  58.42 
 
 
734 aa  777  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  56.44 
 
 
856 aa  730  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  59.91 
 
 
750 aa  799  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  56.8 
 
 
848 aa  740  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  59.54 
 
 
750 aa  793  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  55.5 
 
 
748 aa  739  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  55.74 
 
 
984 aa  978  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  56.21 
 
 
862 aa  700  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  57.16 
 
 
701 aa  746  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  57.88 
 
 
726 aa  806  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  57.34 
 
 
800 aa  878  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  56.32 
 
 
832 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  55.16 
 
 
800 aa  826  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  56.04 
 
 
828 aa  716  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  56.32 
 
 
832 aa  719  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  56.32 
 
 
834 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  55.16 
 
 
800 aa  826  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  59.01 
 
 
750 aa  777  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  57.42 
 
 
800 aa  867  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
939 aa  1890  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
796 aa  671  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  57.4 
 
 
830 aa  738  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  56.49 
 
 
713 aa  718  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  56.92 
 
 
866 aa  732  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  51.68 
 
 
711 aa  699  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  52.38 
 
 
713 aa  707  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  58.43 
 
 
769 aa  789  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  57.18 
 
 
752 aa  758  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  56.35 
 
 
713 aa  717  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  57.61 
 
 
743 aa  717  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  53.9 
 
 
739 aa  706  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  55.04 
 
 
742 aa  729  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  53.92 
 
 
785 aa  695  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  57.2 
 
 
783 aa  729  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  60.2 
 
 
750 aa  798  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  55.33 
 
 
752 aa  781  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05448  metal-transporting P-type ATPase transmembrane protein  49.86 
 
 
784 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481945  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.59 
 
 
712 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
712 aa  583  1e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  44.57 
 
 
712 aa  583  1e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
783 aa  578  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  49.17 
 
 
783 aa  573  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  49.17 
 
 
783 aa  573  1e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  45.72 
 
 
713 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.2 
 
 
709 aa  557  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
673 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  41.63 
 
 
833 aa  555  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 
767 aa  549  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
1022 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  53.04 
 
 
629 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  48.04 
 
 
732 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  43.39 
 
 
737 aa  535  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  43.91 
 
 
707 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2594  heavy metal translocating P-type ATPase  52.82 
 
 
673 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.037296  normal  0.268336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1214  heavy metal translocating P-type ATPase  52.65 
 
 
673 aa  525  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  43.24 
 
 
735 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  46.5 
 
 
751 aa  506  1e-142  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 
793 aa  503  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  36.64 
 
 
868 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
718 aa  487  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
812 aa  487  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  41.04 
 
 
712 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  38.13 
 
 
926 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.69 
 
 
825 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
785 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
734 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  39.21 
 
 
738 aa  475  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
738 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
740 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 
728 aa  470  1e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 
728 aa  470  1e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
635 aa  469  1e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
750 aa  470  1e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
740 aa  469  1e-130  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
726 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
711 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
904 aa  460  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
734 aa  460  1e-128  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>