40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3830 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
232 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  55.22 
 
 
244 aa  262  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  57.41 
 
 
236 aa  244  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  54.55 
 
 
227 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  55 
 
 
235 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  53.3 
 
 
225 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  52.83 
 
 
225 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  52.73 
 
 
217 aa  175  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  43.89 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  36.17 
 
 
213 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  35.5 
 
 
213 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  38.66 
 
 
217 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  38.14 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  36.36 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  36.71 
 
 
223 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  37.02 
 
 
216 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  39.16 
 
 
147 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  35.65 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  32.68 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  29.95 
 
 
444 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.99 
 
 
516 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  25.57 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  28.87 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.73 
 
 
525 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  26.87 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  28.64 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  43.16 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  30.26 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  26.5 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  28.95 
 
 
526 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  27.55 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.14 
 
 
521 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.12 
 
 
509 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  25.41 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.02 
 
 
526 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0415  hypothetical protein  25.77 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.270838  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  24.84 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  30.4 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>