23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2454 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 352 aa  711    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.36 
 
 		 325 aa  89.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  26.02 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  25.1 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  19.31 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  18.92 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  20.16 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  20.08 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  25.82 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.51 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.22 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.69 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  26.36 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>