More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2467 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  39.08 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  31.51 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  30.48 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  31.19 
 
 		 261 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  41.13 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0831  DNA replication protein-like protein  30.96 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  29.25 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  28.32 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  34.29 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  36.03 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  35.94 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  34.33 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  30.77 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  34.04 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  26.12 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  33.77 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  24.5 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  31.87 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  34.03 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  30.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  34.84 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  35.34 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  31.76 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1326  IstB ATP binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  35.1 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  28.3 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  30.59 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  31.43 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  31.88 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0562  AAA ATPase  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107485 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  31.37 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  29.61 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  27.21 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  29.25 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  27.08 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  34.07 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  29.14 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  27.33 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1865  hypothetical protein  26.7 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000860782  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  26.53 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  28.04 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4005  hypothetical protein  30.86 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  26.53 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  26.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  25.14 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  26.7 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0573  AAA ATPase  29.38 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.272998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  27.71 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  27.71 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  27.71 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  28.32 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  25 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  25 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  35.65 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  30.41 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  23.6 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  29.61 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  29.61 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  27.03 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  26.15 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  28 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5325  IstB domain protein ATP-binding protein  25.23 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5450  IstB domain protein ATP-binding protein  25.23 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.532201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  26.07 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  25.15 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  27.22 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  26.85 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  25.59 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>