More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1946 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  875    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  50.17 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  46.38 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  46.41 
 
 		 312 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  46.41 
 
 		 312 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.67 
 
 		 304 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  43.65 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  48.17 
 
 		 302 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  47.51 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.55 
 
 		 407 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  46.67 
 
 		 309 aa  274  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  47.73 
 
 		 318 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  46.84 
 
 		 308 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  47.52 
 
 		 310 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  46.43 
 
 		 318 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  47.56 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  45.78 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  45.78 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.85 
 
 		 306 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  45.78 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  46.43 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  45.78 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  47.88 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  46.71 
 
 		 320 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  42.48 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 		 555 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  45.9 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  43.51 
 
 		 555 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.85 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.74 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.9 
 
 		 556 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  46.1 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 306 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  43.46 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.67 
 
 		 306 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 334 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  42.62 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  44.15 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  43.09 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  42.53 
 
 		 569 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  45.07 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.48 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  43.46 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 308 aa  250  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 318 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  43.79 
 
 		 317 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 310 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.59 
 
 		 319 aa  249  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 311 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  43.73 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  43.73 
 
 		 552 aa  246  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  43.93 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  44.7 
 
 		 310 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 327 aa  246  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  44.38 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  44.01 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  45.39 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  43.23 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  42.62 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  43.79 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  43.28 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  42.19 
 
 		 317 aa  243  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  43 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  43.19 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  43.17 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.46 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  44.13 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  43.37 
 
 		 312 aa  240  4e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  42.99 
 
 		 359 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  44.37 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  45.85 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  41.51 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  43.29 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  41.94 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 460 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  41.94 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 311 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 321 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  40.86 
 
 		 308 aa  237  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  43.71 
 
 		 332 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.43 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  42.24 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  42.24 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  42.24 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.52 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  44.25 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>