More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1244 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 390 aa  797    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.84 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.84 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.4 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.71 
 
 		 324 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 581 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.61 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 1035 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 		 746 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 301 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 318 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 344 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 235 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 1156 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.21 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  50.88 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 847 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 1250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 398 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 		 283 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.44 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 672 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 347 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 341 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.39 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  31.84 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 544 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  32.48 
 
 		 330 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  31.67 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 		 250 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.18 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 597 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 573 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  31.39 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  31.39 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  39.69 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.46 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  32.74 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  46.43 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 275 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  30.26 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 325 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 		 294 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  45.54 
 
 		 233 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 727 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>