More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1624 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.72 
 
 		 714 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.98 
 
 		 714 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  50.14 
 
 		 714 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  52.53 
 
 		 714 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.14 
 
 		 714 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.84 
 
 		 714 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  45.97 
 
 		 720 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 721 aa  1453    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.12 
 
 		 707 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.05 
 
 		 714 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.7 
 
 		 714 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.86 
 
 		 714 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.72 
 
 		 714 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  50 
 
 		 714 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.8 
 
 		 725 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  44.95 
 
 		 708 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.91 
 
 		 690 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.46 
 
 		 690 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  38.89 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.1 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.13 
 
 		 690 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.77 
 
 		 690 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.97 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.2 
 
 		 712 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.63 
 
 		 690 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.05 
 
 		 711 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.8 
 
 		 694 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.21 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.29 
 
 		 690 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.21 
 
 		 690 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.21 
 
 		 690 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.21 
 
 		 690 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.11 
 
 		 692 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.16 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.5 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.18 
 
 		 686 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.06 
 
 		 690 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.54 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.86 
 
 		 703 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.45 
 
 		 692 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.67 
 
 		 741 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.51 
 
 		 700 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.95 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.04 
 
 		 716 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.81 
 
 		 758 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.97 
 
 		 710 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  36.8 
 
 		 750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.89 
 
 		 738 aa  357  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.19 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.05 
 
 		 714 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.05 
 
 		 714 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.82 
 
 		 714 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.91 
 
 		 714 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.36 
 
 		 762 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  35.36 
 
 		 716 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  35.36 
 
 		 716 aa  348  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  35.36 
 
 		 716 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.36 
 
 		 716 aa  348  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.22 
 
 		 716 aa  347  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.36 
 
 		 716 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.85 
 
 		 716 aa  346  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.85 
 
 		 716 aa  346  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.42 
 
 		 726 aa  343  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.42 
 
 		 726 aa  343  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.2 
 
 		 725 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.42 
 
 		 726 aa  342  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 		 732 aa  337  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.75 
 
 		 715 aa  328  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.7 
 
 		 701 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.05 
 
 		 699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.01 
 
 		 699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  33.11 
 
 		 664 aa  297  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  32.66 
 
 		 876 aa  267  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  32.74 
 
 		 840 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  34.34 
 
 		 851 aa  262  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  32.36 
 
 		 843 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  31.98 
 
 		 843 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  32.42 
 
 		 838 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.13 
 
 		 944 aa  251  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  25.84 
 
 		 822 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  32.61 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.93 
 
 		 930 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  30.51 
 
 		 659 aa  240  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.01 
 
 		 934 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  30.48 
 
 		 640 aa  230  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.76 
 
 		 957 aa  230  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.49 
 
 		 709 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  30.96 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  31.31 
 
 		 651 aa  228  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.25 
 
 		 658 aa  227  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  30.93 
 
 		 757 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.35 
 
 		 934 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  28.76 
 
 		 639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  30.61 
 
 		 633 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  30.68 
 
 		 751 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  33.63 
 
 		 681 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  26.22 
 
 		 846 aa  223  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.03 
 
 		 929 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.99 
 
 		 934 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.93 
 
 		 934 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>