25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2295 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  46.2 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  44.29 
 
 		 283 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  41.22 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  40.54 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  43.24 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.1 
 
 		 607 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.89 
 
 		 627 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  35.2 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  32.56 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  34.85 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  30.92 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  27.74 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  29.2 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  31.65 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  28.87 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  34.56 
 
 		 578 aa  68.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 705 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  32.09 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  32.64 
 
 		 561 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  38.55 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  28.29 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 715 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  34.18 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.88 
 
 		 671 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>