More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1233 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.29 
 
 		 524 aa  838    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.81 
 
 		 525 aa  799    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03060  ATP synthase subunit A  73.66 
 
 		 524 aa  794    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.62 
 
 		 526 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.38 
 
 		 526 aa  823    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.58 
 
 		 526 aa  716    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.43 
 
 		 526 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.01 
 
 		 526 aa  715    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  71.37 
 
 		 525 aa  769    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  72.52 
 
 		 524 aa  784    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 		 525 aa  1053    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.86 
 
 		 526 aa  775    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.62 
 
 		 526 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0315  ATP synthase F1, alpha subunit  71.37 
 
 		 534 aa  738    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.42 
 
 		 526 aa  707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.2 
 
 		 526 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  69.67 
 
 		 532 aa  731    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  60.5 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.66 
 
 		 509 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.67 
 
 		 512 aa  616  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.47 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  58.89 
 
 		 541 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  58.86 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.44 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 505 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  59.35 
 
 		 507 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.4 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.05 
 
 		 512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  59.88 
 
 		 507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.58 
 
 		 509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.52 
 
 		 509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  59.72 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 503 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.32 
 
 		 509 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  60.12 
 
 		 507 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.29 
 
 		 503 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.93 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.82 
 
 		 502 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.17 
 
 		 504 aa  601  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  57.93 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 		 509 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.32 
 
 		 509 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.96 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 503 aa  598  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.64 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 503 aa  598  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.11 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.9 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.93 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.47 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.56 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.45 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.79 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.95 
 
 		 510 aa  598  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.74 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.86 
 
 		 502 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.17 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.86 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.09 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.95 
 
 		 502 aa  594  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.45 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  57.28 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.58 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.03 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.24 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58 
 
 		 502 aa  594  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.95 
 
 		 505 aa  594  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.06 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.3 
 
 		 509 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.37 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.68 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.24 
 
 		 501 aa  591  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.32 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.02 
 
 		 502 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.05 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.76 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.38 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.38 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  57.44 
 
 		 507 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>