34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0277 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  47.91 
 
 
225 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  44.8 
 
 
230 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  39.73 
 
 
243 aa  154  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  35.62 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  29.82 
 
 
219 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  29.63 
 
 
236 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  31.09 
 
 
225 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  31.94 
 
 
203 aa  99  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  32.69 
 
 
236 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  28.31 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  32.69 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  32.21 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  30.77 
 
 
273 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  32.21 
 
 
248 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  30.77 
 
 
282 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  31.73 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  31.09 
 
 
246 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  31.09 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  29.05 
 
 
232 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  30.57 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  30.57 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  30.57 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  30.57 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  30.57 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  31.14 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  25.59 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  28.48 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  30.53 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  23.74 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1614  hypothetical protein  28.17 
 
 
91 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>