More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2364 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  75.9 
 
 
309 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  70.82 
 
 
308 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  70.49 
 
 
308 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  72.64 
 
 
314 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  64.29 
 
 
311 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  66.23 
 
 
311 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  64.71 
 
 
308 aa  377  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  66.34 
 
 
309 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  62.66 
 
 
327 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  63.96 
 
 
329 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  64.92 
 
 
309 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  63.19 
 
 
311 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  66.89 
 
 
309 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  60.26 
 
 
309 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.26 
 
 
309 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  65.47 
 
 
319 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  64.38 
 
 
328 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  62.87 
 
 
311 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  65.03 
 
 
309 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.84 
 
 
308 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.71 
 
 
322 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  59.93 
 
 
309 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  59.61 
 
 
309 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  59.48 
 
 
312 aa  361  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.84 
 
 
322 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  59.15 
 
 
312 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  63.64 
 
 
311 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  62.21 
 
 
327 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  61.89 
 
 
310 aa  359  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  62.5 
 
 
317 aa  358  8e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  63.19 
 
 
328 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  62.42 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  64.17 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  61.89 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  58.58 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  57.65 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  62.42 
 
 
308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  60.91 
 
 
317 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  61.04 
 
 
316 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  63.96 
 
 
331 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  57.89 
 
 
311 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.66 
 
 
320 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  60 
 
 
316 aa  352  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  61.97 
 
 
309 aa  351  7e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.99 
 
 
320 aa  351  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  59.93 
 
 
317 aa  350  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.91 
 
 
310 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.35 
 
 
307 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.48 
 
 
308 aa  349  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.31 
 
 
307 aa  349  3e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.36 
 
 
309 aa  349  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  62.3 
 
 
310 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  60.65 
 
 
319 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  54.25 
 
 
304 aa  347  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.87 
 
 
310 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.44 
 
 
311 aa  346  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  60.46 
 
 
308 aa  345  5e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.66 
 
 
308 aa  345  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  60.59 
 
 
326 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  59.74 
 
 
328 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  60.59 
 
 
326 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  64.38 
 
 
309 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  61.24 
 
 
310 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.63 
 
 
324 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  59.22 
 
 
309 aa  340  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55.74 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  59.93 
 
 
325 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  62.21 
 
 
332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  56.58 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  56.68 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.55 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  58.39 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  60.91 
 
 
327 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  63.19 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.59 
 
 
323 aa  335  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  59.48 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  59.61 
 
 
309 aa  335  7e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  63.19 
 
 
332 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  62.66 
 
 
327 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  62.66 
 
 
328 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  57.96 
 
 
330 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.24 
 
 
309 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  61.89 
 
 
322 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.06 
 
 
320 aa  332  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.33 
 
 
320 aa  332  6e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  61.56 
 
 
326 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  56.73 
 
 
320 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  57.74 
 
 
310 aa  329  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  60.78 
 
 
306 aa  329  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  56.31 
 
 
309 aa  329  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  59.15 
 
 
311 aa  329  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  57.1 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  57.1 
 
 
316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  59.28 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  57.19 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  58.69 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  59.02 
 
 
310 aa  326  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.75 
 
 
310 aa  325  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  57.14 
 
 
320 aa  325  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>