103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1928 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
278 aa  575  1e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  4.53787e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  65.57 
 
 
126 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  42.21 
 
 
150 aa  126  4e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  53.04 
 
 
146 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  41.14 
 
 
168 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  41.06 
 
 
148 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  53.98 
 
 
202 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  39.87 
 
 
170 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  39.87 
 
 
168 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  39.41 
 
 
169 aa  118  1e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  49.55 
 
 
172 aa  117  2e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  39.87 
 
 
149 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  39.24 
 
 
149 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  45.45 
 
 
158 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  39.24 
 
 
149 aa  113  4e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  39.24 
 
 
148 aa  113  4e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  46.23 
 
 
178 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  45.69 
 
 
163 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  39.86 
 
 
149 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  39.86 
 
 
149 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  38.96 
 
 
169 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  44.04 
 
 
147 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.5 
 
 
148 aa  82.4  8e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  36.59 
 
 
478 aa  82.4  8e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.59 
 
 
478 aa  82.4  8e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  35.78 
 
 
143 aa  73.2  4e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  39.05 
 
 
143 aa  72.4  7e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.82 
 
 
280 aa  72  9e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.82 
 
 
274 aa  71.6  1e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.71 
 
 
206 aa  71.6  1e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.88 
 
 
284 aa  70.9  2e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  42.55 
 
 
402 aa  68.9  8e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.16 
 
 
266 aa  68.2  2e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.33 
 
 
233 aa  65.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.33 
 
 
233 aa  65.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.33 
 
 
233 aa  65.9  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.33 
 
 
233 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.33 
 
 
233 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.77 
 
 
365 aa  64.7  2e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  36.11 
 
 
246 aa  62.4  8e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  39.6 
 
 
154 aa  62.4  8e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
354 aa  60.8  2e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  4.2827e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  29.41 
 
 
236 aa  60.8  2e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.08 
 
 
165 aa  60.8  2e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.77 
 
 
236 aa  60.5  3e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.63 
 
 
236 aa  59.3  6e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.63 
 
 
236 aa  59.3  6e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.63 
 
 
236 aa  59.3  6e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.63 
 
 
236 aa  59.3  7e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  32.63 
 
 
236 aa  59.3  7e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.63 
 
 
236 aa  59.3  7e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  32.63 
 
 
236 aa  59.3  7e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.97 
 
 
305 aa  58.5  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.5 
 
 
227 aa  57  3e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.5 
 
 
227 aa  57  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.5 
 
 
227 aa  57  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  32.43 
 
 
192 aa  57  4e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  31.17 
 
 
142 aa  56.6  5e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
227 aa  56.2  5e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  5.79479e-08  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.98 
 
 
257 aa  56.2  5e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.64 
 
 
232 aa  53.9  3e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  53.9  3e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.37 
 
 
143 aa  53.1  5e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.8993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  52.8  6e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.97 
 
 
232 aa  52  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.8 
 
 
397 aa  52  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.71 
 
 
229 aa  51.2  2e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.07 
 
 
152 aa  49.7  6e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  31.52 
 
 
401 aa  49.7  6e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.81 
 
 
282 aa  49.3  7e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.93 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.29 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  32.99 
 
 
144 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.67 
 
 
147 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.57 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4206  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.97 
 
 
153 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  33.33 
 
 
157 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.43 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.87 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.64 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.85 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  27.38 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  37.65 
 
 
135 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  37.65 
 
 
135 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  48.98 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.23 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.75 
 
 
524 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.17 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  35 
 
 
147 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2012  hypothetical protein  25.69 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.57 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.84 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  35.82 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.94 
 
 
197 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.84 
 
 
251 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>