39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4206 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4206  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.06 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.06 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.06 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  36.07 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1966  hypothetical protein  42.59 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  33.88 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  33.88 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  34.45 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  24.53 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0718  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0672  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  29.91 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  29.06 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  34 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.22 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.81 
 
 		 236 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  33 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  33 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.57 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.57 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.57 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.57 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.57 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  34.62 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  27.43 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0509  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.03 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  23.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 143 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  30.85 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  33.91 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>