35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2065 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 418 aa  867    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  32.58 
 
 		 883 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  26.65 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  25.51 
 
 		 356 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  27.87 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.05 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  28.81 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.81 
 
 		 368 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.44 
 
 		 392 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.44 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.94 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.4 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.86 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.4 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.07 
 
 		 392 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.4 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  25.44 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.46 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  23.03 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  21.15 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  26.63 
 
 		 327 aa  89.7  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.76 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  23.11 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.27 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 850 aa  66.6  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  24.1 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  27.91 
 
 		 776 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  33.75 
 
 		 993 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  23.4 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  23.56 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>