More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1604 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  51.59 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  46.21 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  45.52 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  54.95 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  47.66 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  42.86 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.91 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  44.04 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  39.23 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  43.2 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  41.96 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  43.12 
 
 		 189 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  43.43 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  34.88 
 
 		 176 aa  90.1  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  41.35 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  38.74 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  42.34 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  41.75 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  43.4 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.9 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  36.94 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  39.09 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  48.19 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.88 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  43.44 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  37.96 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  36.94 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  33.86 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.37 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.45 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  39.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  39.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  39.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  38.05 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  39.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  35.59 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  35.59 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  35.59 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  35.59 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  39.45 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.45 
 
 		 157 aa  84.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.45 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  39.13 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.45 
 
 		 157 aa  84.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.45 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.45 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  34.75 
 
 		 183 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  39.81 
 
 		 184 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  34.82 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  39.36 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.75 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.51 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  41.07 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.53 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  35.45 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.53 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  35.19 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  43.02 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  37.37 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  42.7 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  33.87 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.81 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  39.42 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  34.58 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  34.59 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>