207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1929 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 321 aa  663    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  66.46 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  67.29 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  66.36 
 
 		 321 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  66.04 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  66.04 
 
 		 321 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  66.04 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  66.04 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  66.04 
 
 		 321 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  65.83 
 
 		 319 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  65.73 
 
 		 321 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  66.67 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  62.7 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  59.87 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  60.5 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  60.19 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  54.23 
 
 		 325 aa  361  9e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  54.23 
 
 		 506 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  54.4 
 
 		 321 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  55.1 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  53.92 
 
 		 323 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  54.86 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  52.17 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  53.12 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  51.41 
 
 		 320 aa  341  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  55.93 
 
 		 295 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  51.4 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  50.89 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  44.13 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  43.26 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  42.63 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  42.77 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  75.5 
 
 		 160 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  41.26 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  44.08 
 
 		 334 aa  201  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  38.17 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  38.58 
 
 		 323 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  48.24 
 
 		 180 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  69.52 
 
 		 112 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  30.67 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 		 176 aa  146  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  35 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  32.27 
 
 		 253 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  35.42 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.22 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  34.43 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  30.25 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  35.38 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  70.24 
 
 		 97 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  33.7 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  36.07 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  63.04 
 
 		 101 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  34.97 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  28.34 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  30.99 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  29.23 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  36.7 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  37.65 
 
 		 252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  42.42 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  54.46 
 
 		 101 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  28.12 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  40.28 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  32.13 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  66.67 
 
 		 81 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  35.12 
 
 		 239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  31.45 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  31.1 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.14 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  31.1 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  36.78 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  34.67 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.82 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  36.36 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  32.96 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  31.75 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.17 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  32.14 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  33.88 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 		 241 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  37.24 
 
 		 235 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.54 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  36.55 
 
 		 231 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  36.99 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  30.9 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  34.57 
 
 		 165 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  66.2 
 
 		 72 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.46 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  25.76 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.69 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.09 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  30.14 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  34.67 
 
 		 226 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  29.95 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  30.26 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  28.17 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  31.25 
 
 		 230 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  31.25 
 
 		 230 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>