72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2538 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  100 
 
 
222 aa  434  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  47.03 
 
 
230 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  47.09 
 
 
268 aa  157  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  40.91 
 
 
248 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  46.27 
 
 
225 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  48.8 
 
 
164 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  38.07 
 
 
231 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  42 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  34.48 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  31.96 
 
 
221 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  31.48 
 
 
220 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  31.96 
 
 
223 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  31.96 
 
 
223 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  30.59 
 
 
223 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  31.05 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  31.51 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  38.68 
 
 
207 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  36.18 
 
 
250 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  38.39 
 
 
223 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  32.86 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  55.26 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  25.84 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  38.74 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.05 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.05 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  24.59 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  32.68 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  24.59 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23.08 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  24.31 
 
 
193 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  24.31 
 
 
193 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  41.56 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  22.7 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  24.73 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  24.31 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  24.18 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  29.84 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  23.2 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  25.14 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  32.79 
 
 
211 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  20.54 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  28.5 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  19.13 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  43.33 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  37.93 
 
 
105 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  27.22 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  35.29 
 
 
318 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  34.45 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  33.61 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  33.61 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  29.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  24.34 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  29.12 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  34 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  28.39 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  23.02 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  29.73 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  29.73 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  25.87 
 
 
204 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  35.54 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  27.91 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  32.77 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  29.17 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  30.83 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  30.83 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  33.61 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  22.65 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  26.89 
 
 
314 aa  42  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  25.37 
 
 
348 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  32.5 
 
 
358 aa  41.6  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  31.61 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>