79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1752 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
133 aa  261  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  69.84 
 
 
131 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  64.84 
 
 
132 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 
132 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  63.57 
 
 
132 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  59.26 
 
 
135 aa  150  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  61.72 
 
 
136 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  63.85 
 
 
130 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  60.94 
 
 
133 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  59.12 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  60.77 
 
 
134 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  60.77 
 
 
134 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  61.54 
 
 
134 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  58.91 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  57.36 
 
 
136 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  60.8 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  60 
 
 
135 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  58.14 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  58.14 
 
 
141 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  57.25 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  56.15 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  56.59 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  52.34 
 
 
133 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  55.56 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  52.63 
 
 
134 aa  116  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  55.15 
 
 
133 aa  116  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  58.91 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  55.37 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  54.05 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  54.84 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  34.13 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  44.64 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.67 
 
 
361 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
266 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  44.62 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  44.62 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  41.27 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  40 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  43.24 
 
 
278 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.1 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  39.68 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  31 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  41.54 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  41.38 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  31 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
262 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
282 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
282 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
282 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
282 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
282 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  39.34 
 
 
282 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  39.34 
 
 
282 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  42.86 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  36.51 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.31 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  39.47 
 
 
707 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.51 
 
 
281 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
278 aa  40.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  30.65 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  30.65 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  30.65 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  34.92 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.92 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  34.92 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
353 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.03 
 
 
363 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  42.86 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  34.92 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  34.92 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 
71 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  41.38 
 
 
362 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4123  OrfB family transposase  37.29 
 
 
121 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00660809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>