More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1636 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
499 aa  972    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  53.46 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  53.14 
 
 
531 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  53.5 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  46.22 
 
 
518 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  62.77 
 
 
289 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  40 
 
 
599 aa  289  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  54.83 
 
 
268 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  49.24 
 
 
266 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 
271 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 
266 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 
265 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
266 aa  236  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
266 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.75 
 
 
269 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 
267 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  55.77 
 
 
269 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
266 aa  233  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
269 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  55.38 
 
 
269 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 
269 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
264 aa  231  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1159  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
306 aa  231  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675994 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  54.29 
 
 
269 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  54.29 
 
 
269 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  52.24 
 
 
297 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  55.98 
 
 
323 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
266 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 
269 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  33.27 
 
 
510 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 
267 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  55 
 
 
335 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
266 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  55.93 
 
 
279 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  52.51 
 
 
268 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
267 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
267 aa  219  1e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  54.09 
 
 
268 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
267 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
270 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  55 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  55 
 
 
336 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
268 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
267 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
285 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
268 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
270 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
277 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  48.77 
 
 
266 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 
268 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
269 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
268 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
268 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
267 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
272 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
267 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 
285 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
279 aa  203  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 
264 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  51.84 
 
 
269 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.96 
 
 
270 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 
274 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  51.43 
 
 
269 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
269 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
264 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  51.02 
 
 
269 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  51.02 
 
 
269 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  51.02 
 
 
269 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  51.02 
 
 
269 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  51.02 
 
 
778 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 
288 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
267 aa  193  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 
265 aa  193  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 
277 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  47.39 
 
 
271 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  37.63 
 
 
269 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  43.1 
 
 
288 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  43.1 
 
 
288 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
263 aa  186  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
270 aa  183  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
270 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
265 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
262 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  38.87 
 
 
269 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
267 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>