37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0233 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  60.96 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  49.37 
 
 		 327 aa  155  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  46.48 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  41.22 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  39.74 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  35.92 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  40.41 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  45.37 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  35.29 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  32.62 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  34.45 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  34.97 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  36.89 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  33.64 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  28.47 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  38.32 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  40.74 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  29.5 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  34.26 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  30.94 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  32.35 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  27.43 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  27.27 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  27.08 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  26.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  27.66 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  28.16 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  28.87 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  27.84 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  29.81 
 
 		 148 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  26.21 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>